大中祥符七年二月，徙起居院。为礼仪院故也。
大中祥符八年，荣王宫火，焚及崇文院。命翰林学士陈彭年检讨建置馆阁故事。彭年言：「唐中书、门下两省，宫城之内有内省，宫城之外有外省。今欲据秘阁旧屋宇间数，重修为内院，奉安太宗圣容及御书额，置供御书籍、天文禁书、图画；其四廊并充书库，及史馆日历库。至馆阁直官、校理宿直；校勘及抄写书籍、雕造印版，并就外院，即于左右掖门外近便处修盖，仍别置三馆书库。其三馆书籍名目，候将来分擘正副本，取便安置。」从之。上以内廷火禁甚严，而馆阁羣臣更直寓宿，寒冱之月，饮食非便，因命有司检讨故事而行之。崇文外院既置于左右掖门外，遂以旧地还内藏。
天圣中，祠部员外郎直集贤院谢绛言：「唐室丽正、史官之局，并在大明、华清宫内。太宗肇修三馆，更立秘阁于升龙门左，亲飞白题额，作赞刻石于阁下。景德中，图书寖广，大延天下英俊之士，乃益以内帑西库。二圣因子临幸，亲加劳问，递宿广内，有不时之召。人人力道术，究艺文，知天子尊礼甚勤，而名臣高位繇此其选也。往者延燔之后，简编略尽，访求典籍，是正疑文，而笔工坌集；有司引两省故事，别创外馆，以从缮写考校之便。然直舍卑喧，民栏丛接，大官卫尉，供拟滋削，非先朝所以隆儒育才之本意。愿开内馆，以恢景德之制。」从之。
天圣九年十一月，徙三馆于左升龙门外。嘉佑四年，还崇文院于禁中。内藏库请以前十三间与三馆，诏从之。元丰六年，复以还内藏库。元佑二年，既复置馆职，在省凡二十余员，遂以大庆殿中朝服法物库与内藏库，而嘉佑所广十三间复以归秘书省，于是遂定。
政和中，新作明堂于皇城之东隅，迁左藏库于天汉桥之东北。又度地于端门之东南、驰道之左、横街之南为秘书省。方栋宇未成，迁秘书省于西府之空位。空位二相属，前位居省官与秘阁四库之书，古画、器物咸在；后位为著作局编修会要所。宣和三年，新省成。棂星门东向，在景灵宫东北门少西，殿门南向，中为右文殿。殿之后为道山堂，堂之后为监、少直舍。直舍之后为著作局，局有厅，有直舍、书库、吏舍，周以两庑。右文殿东庑便门之东，秘阁在焉。秘阁之后为提举官厅事，厅事之后为提举官直舍，直舍之后为编修会要所。书局旋罢，不果入。秘阁之南为丞、郎直舍，直舍之南为提举三馆秘阁官厅事，周以四庑，校、正直舍与吏舍、书库等在焉。朱碧辉焕，栋宇宏丽，上邻清都，为京城官府之冠。
